Kiểu rừng chính của Nam Ha là rừng rụng lá thứ sinh hỗn hợp bao gồm rừng thường xanh thứ sinh. Ở khu vực có địa hình thấp, cụ thể là ở đồng bằng Luang Namtha, sự điều chỉnh của con người đối với thảm thực vật và môi trường sống có thể được nhìn thấy bao gồm các rừng tre và bụi rậm.[2]

Các loài động vật đáng chú ý tại đây gồm khỉ Macaca Assam, báo gấm, bò tót, hổ, voi và hoẵng.[2][4] Đây cũng là nơi phát hiện ra loài ếch Amolops akhaorum vào năm 2007.[6] Nó được đặt tên theo người Akha địa phương, những người đã giúp đỡ nghiên cứu thực địa của nhóm phát hiện ra loài này vào năm 2007.[7]

Nam Ha là nơi có nhiều loài chim khác nhau, với khoảng 300 loài được ghi nhận.[2] Một số loài tại Lào chỉ có mặt trong khu bảo tồn này như chào mào mỏ lớn, hoét đuôi dài, khướu cổ trắng.[4]